Das Sozial-Pädagogische Zentrum gliedert sich in die Bereiche Institut für Heilpädagogik (Ambulanz, Station, Tagesklinik), MuK:KI Mutter-Kind-Krisen- und Interventionsinstitut, Tagesheim für Kleinkinder, Ambulatorium „Am Ball“ (ehemals PVBZ) und Verwaltung. Zweck, Aufgaben und Strukturen des SPZ sind im Statut mit Regierungsbeschluss geregelt. Das Land Salzburg ist Rechtsträger des Sozial-Pädagogischen Zentrums und der Bereiche.